203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1318 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
363 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  35.44 
 
 
337 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  38.07 
 
 
375 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  39.16 
 
 
363 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  36.25 
 
 
363 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  36.25 
 
 
363 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  36.25 
 
 
363 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  37.98 
 
 
354 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  36.34 
 
 
341 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  36.34 
 
 
341 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  36.34 
 
 
341 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  35.04 
 
 
362 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  35.04 
 
 
362 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  39.88 
 
 
359 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  34.47 
 
 
362 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.83 
 
 
331 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  35.74 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  38.08 
 
 
345 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  39.64 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  36.47 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  38.81 
 
 
338 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  38.41 
 
 
336 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.24 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  33.05 
 
 
344 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  29.63 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.96 
 
 
399 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.96 
 
 
374 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.03 
 
 
343 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.96 
 
 
345 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  30.92 
 
 
334 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  35.76 
 
 
336 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  38.41 
 
 
339 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  36.98 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  32.5 
 
 
352 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  33.65 
 
 
342 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  34.55 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  34.39 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  35.55 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  30.92 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2671  O-methyltransferase family 2  37.46 
 
 
671 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0838  O-methyltransferase family 2  25.85 
 
 
379 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  34.73 
 
 
345 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  32.32 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5070  O-methyltransferase family 2  28.14 
 
 
369 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.88726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  33.77 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2170  O-methyltransferase family protein  33.44 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2214  O-methyltransferase family protein  33.87 
 
 
371 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  34.14 
 
 
348 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  31.25 
 
 
354 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
392 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2830  O-methyltransferase family protein  35.47 
 
 
339 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.585064  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  24.56 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  29.39 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  28.23 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  25.67 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  30.96 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  30.36 
 
 
623 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.33 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  26.84 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  25.16 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  30.88 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  30.84 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  24.92 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  25 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  27.25 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  28.35 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  27.76 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  27.5 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  30.77 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  30.09 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  26.35 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  27.24 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  27.61 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.77 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  30.77 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.5 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  26.67 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  27.62 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  29.63 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  32.93 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04008  hypothetical O-methyltransferase (Eurofung)  30.77 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0690917  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.6 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  25.08 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  26.33 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  37.5 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00761  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00390915  normal  0.692825 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08569  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.06461 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  26.69 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  26.19 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  26.69 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  26.69 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  26.69 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  26.69 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  26.69 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  26.69 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10889  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>