210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1214 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  100 
 
 
333 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  71.39 
 
 
334 aa  477  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  66.87 
 
 
332 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  59.52 
 
 
335 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  59.52 
 
 
335 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  58.64 
 
 
328 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  56.48 
 
 
329 aa  358  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  49.23 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  33.53 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  34.06 
 
 
353 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  33.91 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  32.33 
 
 
338 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  28.79 
 
 
338 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  31.38 
 
 
352 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  31.86 
 
 
353 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 
392 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  30.72 
 
 
338 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  33.64 
 
 
337 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  34.12 
 
 
378 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  29.58 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  27.93 
 
 
353 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  29.01 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  27.67 
 
 
339 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  32.91 
 
 
344 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  32.53 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1506  O-methyltransferase  32.53 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1589  O-methyltransferase  32.53 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1280  O-methyltransferase family protein, putative  31.74 
 
 
350 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  27.3 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  31.23 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  30.67 
 
 
356 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  28.9 
 
 
340 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  27.38 
 
 
345 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 
352 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
358 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  29.5 
 
 
344 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  28.53 
 
 
341 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  26.9 
 
 
311 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.08 
 
 
363 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.08 
 
 
363 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.08 
 
 
363 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  27.9 
 
 
338 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  27.9 
 
 
338 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  27.9 
 
 
367 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  29.28 
 
 
345 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  27.59 
 
 
473 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  27.59 
 
 
367 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  30.15 
 
 
360 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  27.59 
 
 
367 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  31.49 
 
 
411 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  30.12 
 
 
381 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  32.26 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  29.97 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  28.19 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  28.3 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  28.3 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  28.3 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  28.3 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  28.08 
 
 
359 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  28.3 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  28.3 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  27.57 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  27.58 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.43 
 
 
381 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  29.88 
 
 
385 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  26.95 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.4 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5070  O-methyltransferase family 2  28.53 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.88726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.88 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.88 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  29.45 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  29.79 
 
 
337 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7514  hypothetical protein  27.05 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6371  O-methyltransferase family 2  28.09 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0656  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  26.38 
 
 
375 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0884  O-methyltransferase family protein  29.86 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.27 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.48 
 
 
368 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  27.43 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3676  O-methyltransferase family 2  23.47 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410958  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.16 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  27.38 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  28.09 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  30.86 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  24.62 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  28.96 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  24.81 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  27.44 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1821  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.14 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.71 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  29.73 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  25.15 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  24.9 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  27.44 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  27.22 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  26.4 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  27.44 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>