182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1708 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  100 
 
 
373 aa  738    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  80.38 
 
 
380 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  80.43 
 
 
380 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  68.48 
 
 
381 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  50.54 
 
 
377 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  53.41 
 
 
381 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  50.68 
 
 
381 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  50 
 
 
396 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  53.42 
 
 
375 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  48.77 
 
 
381 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2955  O-methyltransferase family 2  50.41 
 
 
385 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.108248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2728  O-methyltransferase family protein  49.86 
 
 
381 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  44.74 
 
 
378 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3695  O-methyltransferase family protein  52.6 
 
 
392 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  44.44 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  44.44 
 
 
379 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  44.16 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  42.38 
 
 
376 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.62 
 
 
384 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.23 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  30.25 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.23 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.23 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  28.61 
 
 
354 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.56 
 
 
337 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  29.53 
 
 
375 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  32.84 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.27 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.27 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.27 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  27.88 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.57 
 
 
399 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.66 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.05 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  29.19 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  29.55 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  27.58 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  31.07 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  34.27 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  31.07 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  36.41 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  31.07 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  25.79 
 
 
339 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  26.87 
 
 
361 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  28.88 
 
 
337 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  35.75 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  25 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  28.1 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  31.41 
 
 
337 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  28.81 
 
 
337 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  29.18 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  24.11 
 
 
630 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  29.18 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  29.18 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  29.18 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  29.18 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.6 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  29.18 
 
 
337 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  29.18 
 
 
337 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  29.82 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  24.11 
 
 
630 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  34.38 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  27.47 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  27.01 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  25.89 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  26.91 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  26.41 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  26.41 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  26.41 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  30.65 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.19 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  29.5 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  27.27 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  25.89 
 
 
473 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  25.82 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  23.84 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  25.82 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  24.69 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  24.69 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  27.88 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  24.69 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  30.22 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  24.23 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.3 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  28.44 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  26.57 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  29.55 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  26.63 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  30.41 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  27.76 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.41 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  30.06 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.19 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  28.2 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  26.13 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  24.48 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  27.44 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  32.48 
 
 
324 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>