183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4077 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  100 
 
 
356 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7514  hypothetical protein  36.96 
 
 
330 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  32.21 
 
 
343 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  33.22 
 
 
411 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  31.75 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  32.26 
 
 
338 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  32.17 
 
 
338 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  26.57 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  30.67 
 
 
333 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  28.43 
 
 
335 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  28.39 
 
 
328 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  28.19 
 
 
361 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  28.12 
 
 
335 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  32.58 
 
 
337 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
392 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  28.9 
 
 
334 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  27.78 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  27.19 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.28 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  26.51 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  34.07 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  30.6 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  25.21 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
346 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  28.57 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2671  O-methyltransferase family 2  31.31 
 
 
671 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  24.59 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  26.81 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  27.44 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.15 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  28.14 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  27.8 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  28.14 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  26.89 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  26.89 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  25.36 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  26.59 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  26.89 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  27.02 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  26.59 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  26.59 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  29.76 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  24.09 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  41.18 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.57 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  40.34 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  22.53 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  29.94 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  26.95 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.19 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.19 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  28.41 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.17 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  26.4 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  25.37 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  28.82 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  34.62 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  28.42 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  24 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  23.49 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  27.42 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  27.55 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.44 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.01 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  28.09 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.43 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.74 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0884  O-methyltransferase family protein  27.82 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  30.59 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  28.85 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  28.85 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  28.85 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  28.85 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  28.85 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  28.85 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  28.85 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  27.69 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.77 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  30.26 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  25.8 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  24.05 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  23.53 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  28.46 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  23.74 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  33.86 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  28.05 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  24.26 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  28.25 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  28.83 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  26.24 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.39 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.39 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.39 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  26.85 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  20.54 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  25.4 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1589  O-methyltransferase  24.47 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  24.22 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>