92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5794 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  100 
 
 
352 aa  733    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  48.43 
 
 
355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  50.57 
 
 
379 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  50.87 
 
 
355 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  47.43 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  46.57 
 
 
357 aa  341  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  47.71 
 
 
357 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  47.71 
 
 
357 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  48.42 
 
 
357 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  45.3 
 
 
352 aa  332  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  47.84 
 
 
354 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  47.13 
 
 
357 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  47.41 
 
 
356 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  46.99 
 
 
360 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  47.85 
 
 
355 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  46.57 
 
 
359 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  45.71 
 
 
363 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  44.57 
 
 
359 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  45.14 
 
 
357 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  45.14 
 
 
357 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  45.35 
 
 
365 aa  316  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  44.07 
 
 
359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  45.71 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  46.15 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  26.44 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  26.01 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  27.59 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  24.02 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.49 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  25.61 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  22.35 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  26.14 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  22.53 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  24.7 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  26.74 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  24.16 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  25.62 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  26.25 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  27.68 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.38 
 
 
411 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.42 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.22 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.58 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  25.29 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  23.12 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.43 
 
 
331 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  24.39 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  22.22 
 
 
335 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  25.32 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  26.44 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.25 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  23.56 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  26.4 
 
 
338 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  20.82 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  26.55 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  24.69 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  23.08 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  22.32 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  29.81 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  25.77 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  21.88 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  20.67 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  24.3 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  21.88 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  21.51 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  25.79 
 
 
630 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  22.54 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  24.31 
 
 
361 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  25.71 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  21.47 
 
 
339 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  22.54 
 
 
373 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  23.12 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  24.19 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  25.86 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1070  Methyltransferase type 11  23.86 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  27.82 
 
 
630 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.6 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.6 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  24.05 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  23.71 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.6 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  32.86 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  26.55 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  22.73 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  22.54 
 
 
373 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  19.44 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  23.27 
 
 
346 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  28.57 
 
 
361 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  25.13 
 
 
348 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>