94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2121 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
356 aa  741    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  51.69 
 
 
355 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  50.42 
 
 
354 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  48.46 
 
 
357 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  47.88 
 
 
352 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  48.16 
 
 
355 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  47.06 
 
 
357 aa  358  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  46.22 
 
 
360 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  45.66 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  46.5 
 
 
359 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  44.82 
 
 
357 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  45.38 
 
 
357 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  45.94 
 
 
359 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  45.38 
 
 
357 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  46.18 
 
 
379 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  45.94 
 
 
355 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  46.05 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  46.78 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  46.67 
 
 
359 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  43.98 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  43.7 
 
 
357 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  43.7 
 
 
357 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  43.87 
 
 
365 aa  330  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  47.41 
 
 
352 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  29.69 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  26.37 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  26.83 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  22.92 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  31.13 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  24.6 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  23.31 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  30.51 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  25.28 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  23.27 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  23.91 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  30.63 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  25.55 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  28.46 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  24.68 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  20.85 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  19.62 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  20.34 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  20.69 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  21.28 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  21.72 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  24.11 
 
 
353 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  21.89 
 
 
352 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  24.02 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  26.05 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.53 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  27.1 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  24.14 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.86 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  25.81 
 
 
373 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  22.38 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  23.21 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.27 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  20.94 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  23.39 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  21.1 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  20.98 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.17 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  23.42 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  29.91 
 
 
630 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.8 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  28.97 
 
 
630 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.8 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.8 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  22.36 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  21.32 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  21.27 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  23.97 
 
 
376 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  22.49 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1070  Methyltransferase type 11  20.35 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  23.44 
 
 
353 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  20.59 
 
 
341 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  22.12 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  24.54 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.3 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  21.3 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  24.52 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1821  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  20.07 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  22.14 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  19.67 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  22.98 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  27.52 
 
 
339 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  23.58 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  21.09 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3571  SAM-dependent methyltransferase  30.19 
 
 
374 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  22.09 
 
 
337 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  27.52 
 
 
339 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>