180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1418 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 328 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1821  Methyltransferase type 12  88.69 
 
 		 328 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0656  methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  35.24 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2399  O-methyltransferase  28.92 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  28.44 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1315  O-methyltransferase family protein  28.19 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.575705  normal  0.038188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  27.14 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0859  QbsJ-like methyltransferase  25.98 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.226018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1457  O-methyltransferase family protein  29 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  26.99 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  26.38 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1625  O-methyltransferase family protein  25.93 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  26.86 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  28.43 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  26.38 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1487  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  26.2 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  25.91 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  38.18 
 
 		 630 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  27.64 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  38.18 
 
 		 630 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  25.78 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0493  hypothetical protein  21.82 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0924  O-methyltransferase family protein  27.84 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  25.71 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1506  O-methyltransferase  24.6 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  25.26 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  26.05 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.96 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.96 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.96 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  25.34 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  24.67 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1589  O-methyltransferase  24.67 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0428  Methyltransferase type 12  26.6 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0423  hypothetical protein  22.77 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  23.96 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  23.68 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  24.13 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  28.12 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  22.78 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  34.32 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0422  hypothetical protein  23.38 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  24.76 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  24.7 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  22.8 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1280  O-methyltransferase family protein, putative  23.47 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149461  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.12 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  33.7 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  25.65 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1495  hypothetical protein  19.46 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.114106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  32.05 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  25.81 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0412  hypothetical protein  22.75 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.71 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  35 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.71 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  25.96 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  22.41 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  32.95 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1421  O-methyltransferase family protein  24.91 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.513829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  22.92 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  25.93 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.39 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  25.56 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.1 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  29.75 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  29.22 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  23.62 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2553  methyltransferase  22.6 
 
 		 424 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0796954  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  22.64 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  34.42 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  28.49 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.65 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  32.43 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  26.84 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  32.43 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  26.94 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  26.69 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 243 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3571  SAM-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0396758 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3676  O-methyltransferase family 2  26.62 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  21.79 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  25.97 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  32.43 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>