More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1251 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  52.47 
 
 
218 aa  229  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  52.58 
 
 
219 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  50.46 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  48.85 
 
 
219 aa  208  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  46.12 
 
 
218 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  49.07 
 
 
214 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
209 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  40.29 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
209 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  36.71 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.23 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  37.02 
 
 
203 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  34.29 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.89 
 
 
218 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  38.68 
 
 
209 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  37.85 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  37.38 
 
 
215 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  33.5 
 
 
199 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  32.86 
 
 
201 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  29.62 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  29.95 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.03 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  31.31 
 
 
306 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
309 aa  72  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
339 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.67 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  28.76 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  27.62 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  29.44 
 
 
342 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
348 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
334 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  28.47 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  27.83 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.94 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  27.81 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 
312 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.74 
 
 
232 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  29.38 
 
 
307 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
307 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  28.18 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  30.67 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  29.63 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.79 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  31.3 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.51 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  36.27 
 
 
191 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
337 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.01 
 
 
420 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  22.79 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
187 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.62 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  26.76 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  29.75 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  37 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  25.16 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
390 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 
329 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  27.53 
 
 
331 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
275 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30 
 
 
256 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  24.88 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>