More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2865 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  98.8 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  98.41 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  98.01 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  96.81 
 
 		 251 aa  473  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  70.52 
 
 		 251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  70.12 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  70.52 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  70.12 
 
 		 251 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  70.12 
 
 		 251 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  64.14 
 
 		 251 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  55.02 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  53.23 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  53.04 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  48.59 
 
 		 260 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  49.8 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  49.8 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  49.4 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  41.3 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  45.1 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.53 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  39.22 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  41.11 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  38.98 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  33.72 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  36.86 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  37.25 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  37.25 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  36.08 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  32.16 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  35.8 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  37.4 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  38.06 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  38.43 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  34.83 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  35.63 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  38.04 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.88 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  38.04 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  39.37 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  34.11 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  35.5 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  29.96 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  35.27 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.96 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  34.8 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.37 
 
 		 558 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.31 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 		 309 aa  118  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  32.67 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.09 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  31.92 
 
 		 290 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  42.41 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  36.15 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  34.07 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.75 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  31.53 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.11 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 367 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.47 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  31.86 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  25.66 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.29 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  34.3 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 320 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.84 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.65 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.47 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 		 275 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 383 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.64 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.64 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.64 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.64 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.34 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.64 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 374 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.53 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  30.73 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  25.69 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  25.84 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  25.69 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>