84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2107 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  100 
 
 
379 aa  790    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  71.92 
 
 
355 aa  547  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  53.69 
 
 
352 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  54.76 
 
 
354 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  52.27 
 
 
355 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  49.72 
 
 
355 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  52.02 
 
 
363 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  51.28 
 
 
357 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  50.58 
 
 
357 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  50.29 
 
 
357 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  51.28 
 
 
357 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  49.42 
 
 
357 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  50.29 
 
 
359 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  48.58 
 
 
357 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  48.58 
 
 
357 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  48.3 
 
 
357 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  48.86 
 
 
359 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  48.55 
 
 
360 aa  358  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  50.57 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  50.71 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  50 
 
 
355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  46.18 
 
 
356 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  45.89 
 
 
365 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  42.24 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  23.78 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  25.23 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.45 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  24.26 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  26.6 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  30.57 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.06 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  28.66 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  25.48 
 
 
334 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  21.15 
 
 
356 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  26.62 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  23.64 
 
 
350 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  25.95 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  24.86 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.62 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  24.68 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  25.93 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  23.87 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.01 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  24.29 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 
337 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  25.67 
 
 
330 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  23.04 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  24.29 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  20.69 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  24.84 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  22.89 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  23.12 
 
 
352 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.89 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  28.04 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  23.79 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  23.18 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  25.2 
 
 
364 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  22.22 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  24.53 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  22.73 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  24.38 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  24.39 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  24.35 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.36 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.36 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.36 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  23.68 
 
 
381 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.62 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  25.81 
 
 
331 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  25.16 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.75 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  21.26 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  24.19 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  22.22 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  22.29 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.3 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.3 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  25.99 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1530  O-methyltransferase family protein  30.14 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45457  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.76 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  21.9 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  21.88 
 
 
361 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  19.8 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>