92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2905 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  100 
 
 		 357 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  89.92 
 
 		 357 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  90.2 
 
 		 357 aa  680    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  90.48 
 
 		 357 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  81.79 
 
 		 359 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  80.67 
 
 		 357 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  80.67 
 
 		 357 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  80.95 
 
 		 363 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  67.51 
 
 		 357 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  66.39 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  65.55 
 
 		 360 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  66.39 
 
 		 359 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  66.39 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  59.83 
 
 		 359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  53.74 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  53.74 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  50 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  49.42 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  48 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  46.63 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  47.85 
 
 		 365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  44.82 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  46.57 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  44.89 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  28.17 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.58 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.43 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  26.24 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  26.24 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  26.04 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  21.64 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  21.82 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  23.23 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  23.75 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  25.68 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  28.3 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.63 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  21.49 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  31.13 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  26.78 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  24.01 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  21.92 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  22.97 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  23.87 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  22.09 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  24.68 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  22.02 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.67 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  27.35 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.78 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  27.03 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  24.19 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  26.91 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  24.59 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  25.45 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  25.17 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  22.6 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  26.49 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  27.92 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  21.02 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  26.49 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  25.66 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.04 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  23.12 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  22.22 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  23.02 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  26.29 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  22.91 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  22.45 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  23.82 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  23.05 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  25.81 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  28.97 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  26.24 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  21.43 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.71 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  22.82 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  26.17 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  27.1 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  26.17 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.22 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.09 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.09 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.09 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  22.49 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>