110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1560 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  89.92 
 
 		 357 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  97.76 
 
 		 357 aa  727    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  97.76 
 
 		 357 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  100 
 
 		 357 aa  742    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  81.51 
 
 		 359 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  80.95 
 
 		 363 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  80.67 
 
 		 357 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  80.67 
 
 		 357 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  68.91 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  65.55 
 
 		 357 aa  517  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  66.39 
 
 		 359 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  65.55 
 
 		 360 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  67.23 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  60.66 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  53.45 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  52.59 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  47.75 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  49.16 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  49.42 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  48.3 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  45.66 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  48.01 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  47.43 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  46.59 
 
 		 357 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  30.08 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  25.11 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  24.55 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  26.04 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  25.23 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  28.19 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  25.23 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  25.34 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  21.82 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  23.75 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  23.55 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  27.06 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  29.63 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  21.93 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.37 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  24.38 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  25.49 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  25.85 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  21.83 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  27.49 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  24.7 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  25.68 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.44 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  20.72 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  28.66 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  23.81 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.85 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  23.02 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  24.05 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  22.45 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  24.6 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  25.17 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4154  O-methyltransferase family protein  24.86 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  22.12 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  23.97 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  25.71 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  25.93 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  21.59 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  28.04 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  25.34 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  28.04 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  22.3 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  23.53 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.53 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  24.07 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  26.36 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  20.38 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  21.96 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.81 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.81 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  27.1 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.81 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  26.55 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.18 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  23.72 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  25.71 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  22.58 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  23.82 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  23.72 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  24.11 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 310 aa  46.6  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  24.78 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  27.1 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  25.26 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  28.04 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  24.68 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1589  O-methyltransferase  25.66 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1506  O-methyltransferase  25.66 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  22.6 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  21.62 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  22.39 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  22.52 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  32 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>