160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2496 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  100 
 
 		 339 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  81.71 
 
 		 339 aa  590  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  80.83 
 
 		 339 aa  580  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  81.68 
 
 		 339 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  78.64 
 
 		 339 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  75.37 
 
 		 338 aa  532  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  72.57 
 
 		 339 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  71.98 
 
 		 339 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  49.4 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  29.31 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  27 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  26.5 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  29.44 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  29.23 
 
 		 630 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  25.37 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.99 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  27.47 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  25.5 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.21 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1178  O-methyltransferase family protein  26.52 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.01 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  22.12 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  30.51 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.51 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  30.89 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0708  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2305  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2981  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1618  O-methyltransferase  21.82 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  24.61 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  31.67 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  25.57 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1210  O-methyltransferase family protein  21.82 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  24.82 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1051  O-methyltransferase  21.82 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1056  O-methyltransferase  21.82 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  25.64 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  30.36 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  26.42 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.57 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  24.38 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  22.37 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1815  O-methyltransferase family protein  23.49 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2124  O-methyltransferase family protein  24.28 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.77 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0486  O-methyltransferase  26.5 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0388  O-methyltransferase  23.49 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1486  O-methyltransferase family protein  26.5 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2119  O-methyltransferase family protein  26.5 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0802  O-methyltransferase  26.5 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.33 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  27.56 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  25.93 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  23.73 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  27.06 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  23.36 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  27.93 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  26.26 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  24.73 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  23.5 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  32.82 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.62 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  27.64 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  24.52 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  23.66 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  27.64 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  23.44 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  27.64 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  23.44 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.32 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  25.44 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  25.69 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  21.91 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  21.97 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  26.32 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  23.08 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.22 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  22.22 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  22.59 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  24.54 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  24.91 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.85 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  27.11 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  23.75 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  24.72 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  24.75 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  23.4 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  22.91 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  21.11 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  24.39 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  25.22 
 
 		 554 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  26.3 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  26.23 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  22.57 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  23.64 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>