More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1881 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  46.18 
 
 		 291 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  38.41 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  43.61 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  42.75 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  42.75 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  42.7 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  42.02 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  42.02 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  43.3 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  39.42 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  41.97 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  41.04 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  39.21 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  39.18 
 
 		 295 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  38.72 
 
 		 300 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  38.43 
 
 		 295 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  38.95 
 
 		 333 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  37.31 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  37.31 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  39.7 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  36.88 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  36.52 
 
 		 338 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  39.85 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  40.3 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  37.69 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 		 313 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  37.92 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  37.92 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.69 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  36.86 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.78 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  34.9 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.43 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  36.43 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.43 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  36.43 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  36.43 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  36.43 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.35 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  36.96 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  35.82 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  37.35 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.38 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  36.96 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  34.12 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  30.42 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  34.12 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.97 
 
 		 558 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  34.58 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.94 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  34.9 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  35.27 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  35.32 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  32.81 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.92 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  33.46 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.83 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  33.61 
 
 		 310 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.34 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  33.6 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  33.47 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.45 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  27.97 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  29.96 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  29.96 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  40.13 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  40.13 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  29.96 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  29.8 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  29.57 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  30.12 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  33.53 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  33.53 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  33.53 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  33.53 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  29.55 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  33.53 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  33.53 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  32.26 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>