More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0322 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  55.07 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  52.75 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  52.3 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  54.23 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  48.99 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  44.48 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  51.61 
 
 		 291 aa  261  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  48.99 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  48.99 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  48.15 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  48.34 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  48.29 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  46.07 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  38.94 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  38.94 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  41.18 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  39.29 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  41.18 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  39.29 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  41.97 
 
 		 266 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  42.72 
 
 		 333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  41.2 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  44.09 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  39.55 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  43.2 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  42.32 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  38.33 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  40.52 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  41.39 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  39.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  39.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  39.8 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  40.07 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  40.07 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  40.07 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  40.07 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  37.92 
 
 		 262 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  39.41 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.97 
 
 		 558 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  38.06 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  37.31 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.23 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  38.95 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  37.8 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  38.29 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.74 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  38.29 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  38.98 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  38.34 
 
 		 268 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  32.62 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.19 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.55 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  35.74 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 		 267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  38.98 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  35.49 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  37.6 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  36.86 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  36.82 
 
 		 300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  37.21 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.51 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  38.19 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  37.11 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.1 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  36.94 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  33.46 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  34.83 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  32.68 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  32.68 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  30.4 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  32.74 
 
 		 268 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  34.77 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  33.99 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  32.58 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.72 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  35.25 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  41.18 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.33 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.1 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  38.14 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 256 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>