More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2904 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  99.38 
 
 		 321 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  100 
 
 		 321 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  95.95 
 
 		 321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  95.64 
 
 		 321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  95.64 
 
 		 321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  92.52 
 
 		 321 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  95.7 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  79.19 
 
 		 319 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  77.02 
 
 		 338 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  82.45 
 
 		 321 aa  477  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  82.45 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  82.45 
 
 		 321 aa  477  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  82.45 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  82.45 
 
 		 321 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  82.45 
 
 		 321 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  78.26 
 
 		 321 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  80.56 
 
 		 338 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  49.68 
 
 		 300 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  50 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  47.97 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  47.67 
 
 		 367 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  45.11 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  46.36 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  41.64 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  40.62 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  38.73 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  37.54 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  37.8 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  39.87 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  42.55 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.64 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  42.46 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.31 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  41.43 
 
 		 306 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  40.64 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  39.54 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  37.46 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  33.33 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  37.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  37.76 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  40.07 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  38.57 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  37.88 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  37.88 
 
 		 302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  35.88 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  37.46 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  38.36 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  36.21 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  38.33 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  34.41 
 
 		 295 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  37.28 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  35.41 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.04 
 
 		 558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  32.15 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.49 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 251 aa  92.8  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.97 
 
 		 272 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  32.85 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  37.02 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  29.79 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  29.29 
 
 		 262 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  27.04 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 274 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.66 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  28.06 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  31.54 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  26.5 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  30.98 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  36.99 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  35.29 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  34.78 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  30.82 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  38.15 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  29.34 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  34.88 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  26.69 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  32.99 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  37.57 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  36.99 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  34.66 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  26.17 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  27.47 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>