126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1196 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  99.63 
 
 		 270 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  87.13 
 
 		 272 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  61.34 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  61.29 
 
 		 293 aa  294  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  60.07 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  61.67 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  47.8 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  47.95 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  46.95 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  48.12 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  48.12 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  50.19 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  47.79 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  46.18 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  50.18 
 
 		 292 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  59.18 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  51.11 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  53.43 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  47.14 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  50.81 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  50 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  46.32 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  43.97 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  51.42 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  47.41 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  51.34 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  51.49 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  51.31 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  46.48 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  52.11 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  36.68 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  48.97 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  52.06 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  43.81 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  41.34 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  41.27 
 
 		 354 aa  136  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  38.31 
 
 		 376 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  37.8 
 
 		 330 aa  128  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  35.94 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  35.26 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  33.53 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  37.64 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  38.76 
 
 		 294 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  37.64 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  32.95 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.86 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  36.08 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  32.95 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  33.52 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  37.87 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  32.6 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  38.15 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  33.52 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.15 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.15 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.15 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.52 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  31.82 
 
 		 333 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  31.22 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  31.22 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  31.22 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.22 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.22 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  31.22 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  32.5 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  32.5 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  33.72 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  31.01 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  34.59 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  28.71 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  24.55 
 
 		 558 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.43 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  29.3 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>