More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0157 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  55.44 
 
 		 291 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  51.36 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  53.93 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  53.41 
 
 		 292 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  53.03 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  51.11 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  54.23 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  46.56 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  46.88 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  41.24 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  40.28 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  44.56 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  40.85 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  43.3 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  43.46 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  45.7 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  37.19 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  37.19 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  42.05 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  37.32 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  37.89 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  43.27 
 
 		 333 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  38.26 
 
 		 338 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  42.65 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  42.29 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  39.93 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  42.8 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  37.55 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  39.86 
 
 		 321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  41.61 
 
 		 321 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  41.61 
 
 		 321 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.4 
 
 		 558 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  39.86 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  39.86 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.22 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  39.92 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  36.76 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  40.08 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.11 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.79 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  42.62 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.78 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  39.13 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  40.45 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  39.77 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  39.47 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  38.52 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  40.08 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  29.64 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  36.72 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  39.69 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  39.39 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  36.33 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  40.08 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  36.63 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  39.33 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  36.05 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  39.69 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  36.78 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  36.43 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  31.7 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.92 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  36.69 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.55 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  30.1 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  41.67 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  34.71 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  28.73 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  36.4 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  36 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.78 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.78 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  34.34 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  33.7 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.41 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  33.87 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>