More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0312 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  100 
 
 		 333 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  82.45 
 
 		 300 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  63.67 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  62.5 
 
 		 313 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  62.15 
 
 		 313 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  50.32 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  48.88 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  49.34 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  49.01 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  49.34 
 
 		 321 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  49.01 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  47.7 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  49.5 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  47.15 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  47.15 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  49.17 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  49.17 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  49.17 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  49.17 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  48.95 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  46.48 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  41.61 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  39.93 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  42.91 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  44.07 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  39.93 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  44.25 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  37.73 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  42.96 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  36.11 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  36.33 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  38.46 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  38.95 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  43.27 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.97 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  41.09 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  37.64 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  39.42 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  41.13 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  34.32 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  34.32 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  37.02 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  34.48 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  38.06 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  34.8 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  37.28 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  37.28 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  34.69 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  36.53 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  36.88 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  34 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  36.81 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.17 
 
 		 558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  32.28 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.42 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  31 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25.64 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  31.25 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.02 
 
 		 275 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 290 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  26.37 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  34.35 
 
 		 267 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 267 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  32.17 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 267 aa  89.7  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.54 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  32.17 
 
 		 274 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  32.09 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  31.95 
 
 		 267 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  31.3 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  28.2 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  27.37 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  30.87 
 
 		 276 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  30.81 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  26.32 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  27.01 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  30.81 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  30.87 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  28.44 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  30.86 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  28.05 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  31.15 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  28.52 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  26.98 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>