174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1879 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  89.12 
 
 
298 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  65.25 
 
 
292 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  63.29 
 
 
299 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  63.64 
 
 
294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  63.76 
 
 
294 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  57.39 
 
 
296 aa  330  3e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  60.64 
 
 
289 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  57.14 
 
 
296 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  54.96 
 
 
292 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  59.93 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  53.22 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  59.55 
 
 
297 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  50.65 
 
 
320 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  58.65 
 
 
296 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  56.27 
 
 
279 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  56.13 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  53.02 
 
 
304 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  55.6 
 
 
277 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  53.45 
 
 
298 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  54.27 
 
 
312 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  50.19 
 
 
305 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  54.1 
 
 
274 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  55.25 
 
 
299 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  52.98 
 
 
289 aa  246  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  56.32 
 
 
281 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  55.13 
 
 
277 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  51.14 
 
 
279 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  45.82 
 
 
308 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  44.03 
 
 
279 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  54.87 
 
 
293 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  56.04 
 
 
270 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  43.66 
 
 
289 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  55.56 
 
 
270 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  46.56 
 
 
272 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  44.32 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  42.7 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  46.38 
 
 
274 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 
376 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  40.23 
 
 
257 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  35.09 
 
 
330 aa  152  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  33.21 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  42.16 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  42.72 
 
 
348 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  41.76 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  39.02 
 
 
260 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  31.64 
 
 
291 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  36.12 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  34.88 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.88 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  33.7 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.52 
 
 
295 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  29.5 
 
 
307 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.65 
 
 
291 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  33.47 
 
 
295 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
320 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.46 
 
 
294 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  30.07 
 
 
309 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.25 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  36.05 
 
 
240 aa  99.4  7e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.23 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.23 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.19 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.57 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.13 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  32.79 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  30.81 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  28.62 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  34.66 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.41 
 
 
558 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  33.14 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  33.33 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  26.69 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.05 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  30.47 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  28.21 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  30.3 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  35.47 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  34.3 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.95 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  31.85 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  31.65 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  29.52 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  31.01 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  30.7 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>