98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4394 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 304 aa  601  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  64.9 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  62.08 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  62.08 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  60.62 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  58.25 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  60.07 
 
 		 300 aa  355  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  58.84 
 
 		 295 aa  354  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  57.48 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  46.2 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  46.62 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  36.4 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  37 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  35.31 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  37.82 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  34.88 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  34.29 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  36.3 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  36.3 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  36.3 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  38.91 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.3 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.3 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  36.3 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.55 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  32.52 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.41 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.41 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.57 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.57 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  31.54 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.66 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  32.82 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  32 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  34.27 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  31.01 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  31.78 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  34.78 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  34.36 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  30.65 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  26.1 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  26.51 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.1 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.93 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  28.93 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  27.68 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  33.04 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  29.52 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  30.56 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  29.49 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  28.22 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  26.55 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  27.33 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  27.33 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  27.12 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  27.61 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  24.29 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  21.96 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  20.94 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  26.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  30.85 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  24.65 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  27.59 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  30.18 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  23.84 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  28.05 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  22.35 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  26.52 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  25.83 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>