More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0736 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  54.79 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  47.21 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  48.17 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  47.52 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  44.97 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  44.97 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 298 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  48.91 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  46.86 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  48.39 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  43.26 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  45.39 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  37.54 
 
 		 376 aa  208  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  45.22 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  49.08 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  46.1 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  42.91 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  41.89 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  48.53 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  48.53 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  44.11 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  38.58 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  43.05 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  41.06 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  39.32 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  45.12 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  43.53 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  44.04 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  44.85 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  39.48 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  44.12 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  44.85 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  43.94 
 
 		 274 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  42.18 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  47.5 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  47.12 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  52.04 
 
 		 277 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  44.39 
 
 		 348 aa  168  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  52.06 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  51.55 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  34.8 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  41.41 
 
 		 272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  33.82 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  33.92 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  34.18 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  33.94 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  36.07 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.56 
 
 		 295 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  34.53 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  36.65 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  36.2 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  37.09 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  28.3 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  34.03 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  30.66 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.36 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.36 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  31.67 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  29.39 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  33.45 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  31.14 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  31.14 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.3 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  34.15 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  31.75 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.45 
 
 		 269 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.7 
 
 		 268 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  32 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  32.73 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  32.73 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  32.73 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  32.73 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  30.07 
 
 		 367 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.22 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  29.81 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  29.43 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  35.67 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  27.21 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  25.09 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.48 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>