172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2968 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 299 aa  583  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  63.51 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  62.24 
 
 		 295 aa  325  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  62.63 
 
 		 292 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  62.94 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  62.11 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  63.16 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  63.16 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  59.29 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  56.08 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  56.08 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  57.05 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  54.58 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  57.88 
 
 		 279 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  54.67 
 
 		 292 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  57.71 
 
 		 289 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  56.36 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  54.21 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  52.1 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  51.75 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  51.93 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  57.3 
 
 		 277 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  56.54 
 
 		 281 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  55.17 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  52.26 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  51.12 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  53.14 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  44.71 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  55.04 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  47.1 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  57.95 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  48.04 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  50.35 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  59.7 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  59.2 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  46.92 
 
 		 289 aa  185  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  44.27 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  47.5 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  33.73 
 
 		 354 aa  166  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  33.75 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  32.18 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  43.89 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  40.47 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  41.49 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  38.55 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  40.15 
 
 		 260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  37.41 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  36.46 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  38.55 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  37.05 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.82 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  41.21 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  33.21 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  36.26 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.27 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  37.57 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.58 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  36.42 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  36.42 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  32.63 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.97 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.72 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.72 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  35.2 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  34.16 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 280 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  32.65 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.59 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  36.22 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.79 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  33.92 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  36.41 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  36.41 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  36.41 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.41 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.41 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  36.41 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  34.22 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  32.43 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.36 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>