123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0668 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
320 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
304 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  35.08 
 
 
264 aa  109  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
289 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
295 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
311 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
292 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  29.74 
 
 
263 aa  102  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
296 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  40 
 
 
297 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  40 
 
 
297 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  38.46 
 
 
312 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
296 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  36.14 
 
 
279 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  36.05 
 
 
297 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  36.05 
 
 
297 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  37.28 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
292 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  35.98 
 
 
281 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
299 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  33.74 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
298 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  36.18 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  34.59 
 
 
294 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  32.09 
 
 
289 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  34.91 
 
 
272 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  31.87 
 
 
308 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  36.76 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  32.48 
 
 
299 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
298 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  34.55 
 
 
277 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  34.55 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  29.36 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  32.95 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  32.95 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  30.49 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  30.73 
 
 
279 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  37.3 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  24.89 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  24.43 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  28.37 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  28.37 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  26.03 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.19 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.19 
 
 
281 aa  79  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  26.85 
 
 
294 aa  78.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  26.78 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  26.73 
 
 
294 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  25.43 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.67 
 
 
558 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  29.82 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  33.54 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  30.82 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  29.09 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  27.84 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  27.49 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  23.28 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  29.39 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  26.64 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  27.32 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  24.62 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.94 
 
 
321 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
321 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  30.23 
 
 
338 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  27.17 
 
 
367 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  23.4 
 
 
333 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
321 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  26.75 
 
 
310 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  22.39 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
313 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  22 
 
 
284 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
319 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  26.13 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  26.16 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  23.37 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  22.58 
 
 
300 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  23.2 
 
 
300 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  22.81 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  25.55 
 
 
310 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  23.89 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  25 
 
 
280 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  23.12 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>