244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0560 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  46.86 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  41.46 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  46.77 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  43.1 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  43.16 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  42.52 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  42.52 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  42.86 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  45.49 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  45.42 
 
 		 296 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  43.85 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  41.81 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  43.13 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  42.12 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  40 
 
 		 294 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  40.21 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  40.94 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  40.49 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  42.51 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  39.72 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  33.22 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  42.47 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  44.27 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  40.27 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  39.16 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  42.25 
 
 		 277 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  38.75 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  37.6 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  27.54 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  35.66 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  38.21 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  36.52 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  37.95 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  30.69 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  36.27 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  39.91 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  39.91 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  37.43 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  27.1 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  28.74 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  32.83 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  31.27 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  27.84 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.58 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.58 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.5 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.4 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  27.97 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  26.92 
 
 		 295 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  34.3 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.09 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  24.73 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  30.64 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  26.2 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  27.82 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  26.2 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  35.26 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.32 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.77 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  30.47 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  28.41 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  29.21 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  25.85 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  25.85 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.88 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  23.42 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  30.36 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  22.37 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  29.76 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  31.28 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  31.28 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.79 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  31.28 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  31.28 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.28 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.28 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>