More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2279 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  598  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  98.24 
 
 
284 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  40.31 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.13 
 
 
292 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.13 
 
 
292 aa  218  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  42.75 
 
 
266 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  36.79 
 
 
295 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  37.82 
 
 
307 aa  208  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  38.55 
 
 
297 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  39.11 
 
 
309 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  39.69 
 
 
306 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.16 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  35.94 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  35.94 
 
 
281 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  36.99 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  38.23 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.89 
 
 
290 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  36.55 
 
 
338 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  36.74 
 
 
291 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  36.68 
 
 
300 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  39.01 
 
 
313 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
321 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
321 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  38.03 
 
 
321 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  38.03 
 
 
321 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  36.11 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.41 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  39.36 
 
 
367 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.28 
 
 
321 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  37.28 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  39.93 
 
 
313 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  34.73 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  38.13 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  34.35 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
320 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  34.87 
 
 
294 aa  175  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  38.49 
 
 
279 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.17 
 
 
321 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  36.17 
 
 
321 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  36.49 
 
 
338 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  36.17 
 
 
321 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  36.17 
 
 
321 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  35.25 
 
 
338 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  36.49 
 
 
338 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.89 
 
 
267 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.59 
 
 
558 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  31.8 
 
 
279 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.35 
 
 
268 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.68 
 
 
268 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  33.75 
 
 
272 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  32.92 
 
 
274 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  33.46 
 
 
310 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.5 
 
 
312 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  30.28 
 
 
269 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  33.75 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  32.08 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  29.72 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  33.61 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  29.88 
 
 
269 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  32.92 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 
300 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
267 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  31.42 
 
 
280 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  29.71 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.3 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 
267 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  29.3 
 
 
255 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  29.17 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  30.68 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  32.26 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  29.85 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.54 
 
 
272 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  32.18 
 
 
295 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  27.94 
 
 
267 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  27.94 
 
 
267 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  27.94 
 
 
267 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  27.82 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
278 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  31.87 
 
 
304 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.07 
 
 
253 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  30 
 
 
267 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.23 
 
 
253 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
271 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.57 
 
 
269 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  29.48 
 
 
317 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  29.88 
 
 
305 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  28.73 
 
 
302 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  27.84 
 
 
260 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  28.36 
 
 
302 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>