More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0497 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  89.55 
 
 		 269 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  79.1 
 
 		 268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  73.23 
 
 		 272 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  69.43 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  72.86 
 
 		 272 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  72.86 
 
 		 276 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  71 
 
 		 272 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  70.59 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  70.61 
 
 		 274 aa  351  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  67.16 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  39.85 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.78 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  43.68 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  40.96 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  43.7 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  42.01 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  41.57 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  40.23 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.51 
 
 		 558 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  42.05 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  40.31 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  40.31 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  38.29 
 
 		 307 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  41.29 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  40.91 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  40.91 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  38.46 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  35.16 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  37.45 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  41.96 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  40.78 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  39.06 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  37.74 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  36.93 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  34.23 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  37.34 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  38.06 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  34.12 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.28 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.28 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 		 251 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  37.89 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  36.33 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  36.25 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 216 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  36.74 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  39.15 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  35.83 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  35.83 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.6 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  32.27 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  35.42 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  35.42 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  35.42 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  35.42 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  32.27 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  35.42 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  36.82 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  36.4 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  34.63 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.73 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  36.4 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  33.58 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  35.98 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  35.98 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  33.08 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.41 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.31 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  32.34 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  32.16 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  31.87 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  31.76 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  30.98 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  31.91 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  30.42 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.51 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  28.84 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.51 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  38.08 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.25 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.14 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.14 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.14 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.14 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.14 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>