More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2555 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  100 
 
 		 315 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  35.69 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  34.33 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  33.96 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  30.48 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.01 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  35.51 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  33.46 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.59 
 
 		 255 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  35.93 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  37.12 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 260 aa  132  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.38 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  33.85 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  34.38 
 
 		 274 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  31.56 
 
 		 253 aa  124  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  35.81 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  35.81 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.06 
 
 		 268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  31.3 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.71 
 
 		 558 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  32.83 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  31.05 
 
 		 267 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  30.65 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  30.65 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  26.87 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  27.78 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  27.96 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  28.97 
 
 		 251 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  31.27 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  28.97 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.37 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.73 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  27.7 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  28.79 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  28.79 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  28.17 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  28.17 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  24.44 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 		 251 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 		 251 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  27.27 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.98 
 
 		 272 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.73 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.68 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.36 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  27.34 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  28.07 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  26.02 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  25.65 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 216 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  29.04 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  26.57 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  30.04 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.54 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.54 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.54 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.54 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.54 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  28.07 
 
 		 269 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  28.37 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  30.36 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  24.43 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.54 
 
 		 269 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  24.23 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.54 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 262 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.64 
 
 		 269 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  29.91 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  26.59 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  27.99 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  25.11 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  26.53 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>