251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1477 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  48.55 
 
 		 309 aa  258  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  47.22 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  46.25 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  48.43 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  41.69 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  46.67 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  47.06 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 309 aa  214  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  41.5 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  39.87 
 
 		 383 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  39.54 
 
 		 374 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  43.92 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  47.06 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  45.56 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  46.12 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  31.8 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  32.05 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  28.52 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  31.95 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.41 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.8 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.38 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.46 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  29.74 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  31.49 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  31.49 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  31.49 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  31.49 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  31.49 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  31.49 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  28.95 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.62 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.42 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.2 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  30.42 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  30.42 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  30.42 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30.42 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  30.17 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.3 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  31.35 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  26.91 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.56 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  26.26 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  29.88 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  31.28 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.57 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30.36 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.92 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  27.47 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  29.31 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  27.47 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.48 
 
 		 558 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  30.8 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  26.94 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.13 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  28.11 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  29.17 
 
 		 291 aa  85.5  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.81 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  30.13 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  31.28 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  28.02 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  28.02 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  27.2 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  26.01 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  29.67 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  26.96 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  29.27 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  26.44 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  26.09 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  29.41 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  24.42 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  26.24 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  28.03 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  24.34 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  27 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  25.44 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  27.59 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.2 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.41 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  24.46 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  24.81 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  25.14 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  24.81 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  24.91 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  23.79 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>