More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1128 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  45.85 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  44.69 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  45.85 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  45.85 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  45.13 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  43.68 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  44.62 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  44.8 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  45.63 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  42.37 
 
 		 267 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  46.72 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  40.07 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  40.08 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  39.68 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  40.3 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  41.15 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  35.98 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  37.07 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.09 
 
 		 312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  36.36 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  37.84 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.98 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  39.37 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  32.31 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  42.4 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  42.19 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  39.13 
 
 		 290 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  39.64 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  39.64 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  40.93 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  39.64 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  36.95 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  38.84 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  37.22 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  36.55 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  38.74 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  40.43 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  33.99 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  38.3 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  33.99 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  35.44 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  38.55 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.72 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  29.72 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.77 
 
 		 558 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  36.67 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  31.7 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  35.32 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  36.68 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  33.61 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  37.44 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  35.19 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.2 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  35.19 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  35.19 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  34.76 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  34.76 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  34.76 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  34.76 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  34.76 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  32.31 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  31.56 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  31.56 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  31.56 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  31.56 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  31.15 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  32.46 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  36.42 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  37.09 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  31.25 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  35.76 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  35.76 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  35.76 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  35.76 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  35.76 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  26.25 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  34.98 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  28.95 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  35.76 
 
 		 269 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  28.7 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  35.1 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  28.7 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  40.37 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 367 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  31.19 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  40.65 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>