More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3244 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  59.63 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  60.9 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  55.19 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  56.39 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  47.27 
 
 		 278 aa  214  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  43.7 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  41.57 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  47.04 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  49.62 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  49.62 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.4 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  49.24 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  37.36 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  35.44 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.91 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  33.22 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  34.6 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  34.6 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35.45 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  31.8 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.21 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  31.42 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  33.72 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.35 
 
 		 558 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  30.15 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  30.15 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  32.31 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.71 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  31.3 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  30.34 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  35.47 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  34.59 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.69 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  34.46 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  34.59 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  35.09 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.96 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  33.08 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.32 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  28.67 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  30.97 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.66 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 320 aa  98.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.04 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.08 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  29.93 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.27 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.28 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.27 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.27 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.27 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.27 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 315 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  33.61 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  28.51 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  24.55 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.66 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  31.2 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  27.99 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  28.11 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.91 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.3 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.91 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.91 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  27.78 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.79 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  29.96 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  26.87 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  28.43 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.49 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  29.81 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  26.2 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  30.94 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.08 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  32.65 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  30.43 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  28.25 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.15 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25.94 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  28.67 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.46 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  27.44 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  27.44 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>