280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0938 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  100 
 
 
304 aa  591  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  61.2 
 
 
320 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  56.19 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  55.07 
 
 
305 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  57.46 
 
 
296 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  58.05 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  54.85 
 
 
295 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  52.94 
 
 
298 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  53.02 
 
 
297 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  53.02 
 
 
297 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  57.2 
 
 
296 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  53.26 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  49.17 
 
 
299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  54.48 
 
 
279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  55.64 
 
 
297 aa  251  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  56.25 
 
 
297 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  51.54 
 
 
292 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  50.68 
 
 
294 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  51.17 
 
 
289 aa  242  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  49.83 
 
 
294 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  52.07 
 
 
312 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  54.44 
 
 
299 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  53.76 
 
 
277 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  51.32 
 
 
274 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  49.48 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  50.17 
 
 
281 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  47.52 
 
 
308 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  41.44 
 
 
296 aa  209  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  49.77 
 
 
293 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  42.71 
 
 
289 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  50.57 
 
 
277 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  49.04 
 
 
279 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  44.71 
 
 
289 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  50.49 
 
 
279 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  53.92 
 
 
270 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  53.43 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  53.81 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  40.68 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  41.6 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  35.67 
 
 
330 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  40.75 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  37.08 
 
 
264 aa  160  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 
348 aa  159  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  35.63 
 
 
263 aa  158  9e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  42.21 
 
 
376 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  35.74 
 
 
354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  36.17 
 
 
291 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  35.27 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.31 
 
 
309 aa  132  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  34.46 
 
 
292 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  34.46 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  34.19 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  30.18 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.6 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  35.6 
 
 
240 aa  112  9e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  37.08 
 
 
260 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.66 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  29.63 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.66 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
295 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  33.45 
 
 
263 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  32.33 
 
 
294 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
294 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  36.65 
 
 
320 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  30.66 
 
 
309 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  27.47 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  36.21 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  31.12 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  31.62 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.74 
 
 
269 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  34.04 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  36.78 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
321 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  30.24 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.92 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.52 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  34.7 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30.45 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  27.76 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.02 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.79 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  34.22 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  28.08 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  27.72 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  34.76 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>