197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0481 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  85.26 
 
 		 289 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  73.57 
 
 		 279 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  74.55 
 
 		 277 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  72.99 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  71.17 
 
 		 281 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  72.36 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  63.28 
 
 		 296 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  56.49 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  56.84 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  63.48 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  60.76 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  61.27 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  59.72 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  54.49 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  54.36 
 
 		 298 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  53.04 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  55.02 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  55.02 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  54.77 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  53.29 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  50 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  52.07 
 
 		 304 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  50.7 
 
 		 294 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  56.36 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  43.79 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  50.87 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  48.26 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  46.37 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  46.47 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  46.98 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  45.49 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  46.18 
 
 		 289 aa  195  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  46.55 
 
 		 272 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  47.78 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  47.41 
 
 		 270 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  44.29 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  41.06 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  42.51 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  40 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 257 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  40.15 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  31.18 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  36.69 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  41.28 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  39.18 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  39.53 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  37.77 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  40.46 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  38.95 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  38.46 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  32.65 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.15 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.15 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  40.94 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  34.94 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  38.46 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  40.12 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  30.8 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  33.7 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  32.97 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  36.31 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  32.97 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.72 
 
 		 558 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  25.8 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  29.76 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  29.37 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  29.26 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  25.59 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  28.06 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  31.46 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  26.18 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.88 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  30.19 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  27.49 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.33 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  31.58 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  26.17 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.34 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.57 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  28.57 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  28.24 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>