111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0876 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  83.39 
 
 		 300 aa  497  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  64.97 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  62.41 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  62.07 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  61.38 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  60.98 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  59.67 
 
 		 317 aa  353  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  60.62 
 
 		 304 aa  351  7e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  45.17 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  47.37 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  39.16 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  39.16 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  39.16 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  39.16 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  39.16 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  39.16 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  37.02 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  37.76 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.5 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  37.15 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  37.15 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  39.03 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  39.62 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  36.24 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  40.73 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  34.17 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  37.01 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  34.66 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.14 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  35.56 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  34.66 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  35.15 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  33.6 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.95 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  34.02 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.31 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  30.58 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.56 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.74 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  32.3 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  31.85 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  31.85 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  33.12 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  29.26 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  31.65 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  32.32 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  31.01 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  29.94 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  27.8 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.24 
 
 		 558 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  32.93 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  32.7 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  31.01 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  29.8 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  24.89 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  30.5 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  28.52 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  25 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  27.22 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 376 aa  52.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  25 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  24.55 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  32.67 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  24.62 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>