197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0385 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  89.56 
 
 		 297 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  89.49 
 
 		 297 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  66.89 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  65.87 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  65.52 
 
 		 296 aa  346  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  67.66 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  62.45 
 
 		 289 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  62.95 
 
 		 279 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  56.7 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  56.66 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  56.66 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  58.12 
 
 		 320 aa  291  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  59.72 
 
 		 312 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  54.58 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  56.04 
 
 		 299 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  56.04 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  55.09 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  62.11 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  59.85 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  52.07 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  59.36 
 
 		 274 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  51.7 
 
 		 294 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  59.23 
 
 		 277 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  53.33 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  57.19 
 
 		 277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  52.59 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  47.24 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  48.48 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  46.32 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  57.28 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  46.98 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  49.08 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  50.71 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  58.02 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  45.42 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  57.55 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  45.77 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  49.24 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  38.11 
 
 		 330 aa  165  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  45.3 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  42.44 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  45.45 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  34.35 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  42.21 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  40.35 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  39.39 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.07 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  40.23 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  39.43 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  42.22 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  38.82 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  36.99 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  38.25 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  37.88 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.71 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  36.72 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  34.69 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  32.42 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  37.93 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  37.93 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  37.8 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  32.52 
 
 		 333 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.63 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.63 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.79 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.74 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  28.87 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  32.53 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  34.32 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.98 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  31.46 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  32.98 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.25 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  27.83 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  33.33 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  28.21 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  32.69 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  33.52 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.87 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  35.56 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.77 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  35.56 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>