157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3971 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  69.58 
 
 		 294 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  64.58 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  67.37 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  60.64 
 
 		 297 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  60.64 
 
 		 297 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  58.51 
 
 		 298 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 292 aa  305  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  50 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  53.15 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  53.68 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  53.68 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  51.55 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  52.49 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  51.72 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  52.09 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  49.48 
 
 		 304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  49.27 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  51.06 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  51.89 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  46.77 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  54.17 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  51.14 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  51.5 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  48.26 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  49.43 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  46.91 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  44.25 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  42.11 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  50.5 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  47.52 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  54.4 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  53.89 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  41 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  34.6 
 
 		 376 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  33.8 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  41.73 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  32.42 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  40.4 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 		 348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  37.13 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  39.43 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  34.68 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  32.83 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  35.43 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  34.6 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.91 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.8 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.56 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  37.08 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.26 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  36.6 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  34.68 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.66 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  33.16 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  34.25 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  33.13 
 
 		 240 aa  85.9  7e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  29.63 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.85 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  34.41 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  30.41 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.82 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.82 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.04 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  30.71 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  31.79 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  31.79 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  31.79 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.79 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.79 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  31.79 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  28.74 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  29.9 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  30.27 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  28.49 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.14 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  29.73 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.15 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  31.15 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  30.77 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>