79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1646 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  100 
 
 
290 aa  590  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  70.52 
 
 
251 aa  357  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.54 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.54 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  32.62 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.56 
 
 
309 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  33.96 
 
 
297 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  30.86 
 
 
281 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  30.56 
 
 
333 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
320 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  30.48 
 
 
281 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
313 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  29.25 
 
 
338 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  31.38 
 
 
367 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 
290 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32 
 
 
291 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  30.3 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
313 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.14 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  30 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  29.02 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
321 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  31.66 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  29.66 
 
 
321 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  29.66 
 
 
321 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  29.66 
 
 
321 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  29.66 
 
 
321 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  29.66 
 
 
338 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  29.66 
 
 
338 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  30.95 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  31.91 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
321 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  30.86 
 
 
300 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.97 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  29.35 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  31.6 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.8 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  29.18 
 
 
279 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  28.99 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  29.64 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  31.85 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  26.88 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  27.53 
 
 
300 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  28.68 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  28.68 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  28.21 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  28.32 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  27.49 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.21 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  24.91 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  40.85 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  27.52 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  32.48 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  29.82 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  44.23 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  45.1 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  45.1 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  45.1 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  41.82 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  24.56 
 
 
240 aa  42.7  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  43.94 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  53.85 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  47.27 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  43.94 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  47.27 
 
 
274 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
292 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>