165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3007 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  65.25 
 
 		 297 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  65.25 
 
 		 297 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  61.46 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  57.73 
 
 		 299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  56.16 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  55.33 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  51.92 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  54.55 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  54.58 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  55.05 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  55.77 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  57.69 
 
 		 311 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  57.03 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  54.39 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  54.04 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  50.51 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  53.98 
 
 		 289 aa  254  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  54.24 
 
 		 281 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  54.96 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  55.56 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  53.26 
 
 		 279 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  51.54 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  50.56 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  55.43 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  49.07 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  53.64 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  53.31 
 
 		 277 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  47.21 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  44.57 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  42.91 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  53.54 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  55.34 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  54.85 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  44.83 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  46.23 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  51.53 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  42.26 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 376 aa  162  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  42.78 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  32.63 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  48.21 
 
 		 257 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  42.63 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  42.39 
 
 		 348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  39.47 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  36.87 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  36.47 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  35.71 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.63 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.64 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  34.64 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  34.36 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  34.64 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  33.51 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  32.35 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  34.12 
 
 		 307 aa  95.9  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.16 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.14 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  31.71 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.28 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  28.74 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  32.79 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  30.27 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  31.02 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.4 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.4 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  31.68 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  31.06 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  32.75 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  30.49 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  32.16 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  31.28 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.06 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.88 
 
 		 558 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.89 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  32.74 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  34.07 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  29.27 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  32.92 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  28.31 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  32.56 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.4 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  28.15 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  30.49 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  25.45 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>