177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1136 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  100 
 
 
298 aa  603  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  59.73 
 
 
295 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  58.33 
 
 
296 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  58.5 
 
 
292 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  65.79 
 
 
299 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  58.19 
 
 
311 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  56.13 
 
 
279 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  56.57 
 
 
297 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  56.57 
 
 
297 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  55.47 
 
 
296 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  53.1 
 
 
298 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  53.26 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  50.51 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  54.36 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  52.74 
 
 
320 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  52.54 
 
 
289 aa  271  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  49.83 
 
 
299 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  53.79 
 
 
297 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  53.79 
 
 
297 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  49.32 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  49.33 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  53.51 
 
 
274 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  56.06 
 
 
277 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  54.92 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  50.19 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  51.55 
 
 
289 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  54.48 
 
 
277 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  47.16 
 
 
296 aa  245  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  46.44 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  44.48 
 
 
279 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  45.49 
 
 
293 aa  215  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  48.14 
 
 
270 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  47.8 
 
 
270 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  43.43 
 
 
289 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  46.5 
 
 
272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  43.1 
 
 
308 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  45.23 
 
 
274 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  40.75 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  39.48 
 
 
305 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  34.63 
 
 
354 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
257 aa  155  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  34.06 
 
 
330 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  41.08 
 
 
348 aa  146  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  30.45 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.96 
 
 
295 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.59 
 
 
295 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  39.64 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  36.76 
 
 
260 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  31.43 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.48 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  31.38 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.8 
 
 
294 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  29.96 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.68 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.46 
 
 
309 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  27.43 
 
 
307 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  32.25 
 
 
263 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.68 
 
 
281 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  28.22 
 
 
291 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.29 
 
 
281 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  29.12 
 
 
306 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  30.96 
 
 
320 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  32.07 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  32.07 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.07 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  29 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.28 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  35.29 
 
 
240 aa  96.3  6e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  31.27 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
319 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  29.15 
 
 
338 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  29.35 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  27.6 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  30.83 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  25.94 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  29.59 
 
 
367 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  27.86 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  24.58 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  23.69 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.38 
 
 
558 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  26.01 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  31.46 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  31.46 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  31.46 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.46 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  31.46 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  31.46 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  28.03 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.84 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  28.51 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>