More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0216 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 313 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  97.12 
 
 		 313 aa  577  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  88.5 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  62.46 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  61.76 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  48.47 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  46.3 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  47.19 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  47.35 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  47.35 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  47.35 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  47.02 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  47.35 
 
 		 321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  46.69 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  46.69 
 
 		 338 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  46.69 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  46.69 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  46.69 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  46.69 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  46.03 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  46.03 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  48.07 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  43.15 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  37.87 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  41.72 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  37.87 
 
 		 284 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  41.2 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.21 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  42.34 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.21 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  39.12 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  41.16 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  40.33 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.87 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  39.01 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  36.39 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  39.6 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  36 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  32.33 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  32.33 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  40.07 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  37.67 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  38.29 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.78 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  34.22 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  33.44 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  33.44 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  36.25 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  38.91 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  38.91 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  36.23 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  35.9 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  34.97 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  36.43 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.22 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  27.86 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.04 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  30.96 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  26.06 
 
 		 279 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.74 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  24.13 
 
 		 558 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  29.49 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  26.77 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  30.04 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  28.81 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  25.71 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.62 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  27.1 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  25 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  28.67 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  29.1 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  26.73 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  27.86 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  26.44 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.37 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  27.48 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  31.89 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.58 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  28.86 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  26.62 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  26.62 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>