More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2357 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 275 aa  563  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  93.45 
 
 		 275 aa  530  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  89.45 
 
 		 275 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  88.73 
 
 		 275 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  63.04 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  56.85 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  55.17 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  52.98 
 
 		 374 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  52.79 
 
 		 383 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  52.59 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  49.45 
 
 		 309 aa  250  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  47.58 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  49.21 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  46.48 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  35.02 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  34.85 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.95 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.03 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.24 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  31.84 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.75 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  32.64 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  28.46 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.05 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  31.76 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.4 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  33.6 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  31.34 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  31.06 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  31.76 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.24 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  32.38 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.09 
 
 		 251 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  31.09 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  27.86 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.09 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  30.57 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  30.57 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  30.57 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  30.57 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.98 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  30.57 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  29.96 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  33.16 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  33.16 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  33.16 
 
 		 251 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  29.02 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  31.97 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.8 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  32.64 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.8 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 315 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  40.65 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.46 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  32.64 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.99 
 
 		 558 aa  89  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  29.76 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  29.62 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.45 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  30.05 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  26.61 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  28.63 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  28.02 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.14 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  29.58 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  28.44 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  23.13 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  24.01 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.79 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.25 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.03 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  26.1 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  21.07 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.77 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.61 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  21.29 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  25.97 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.58 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  26.43 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.17 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.33 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>