More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1535 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  100 
 
 
265 aa  522  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  85.55 
 
 
266 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  58.37 
 
 
261 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  35 
 
 
264 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
265 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  45.26 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  31.7 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 
225 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  42.55 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.88 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.68 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  38.21 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.5 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.81 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  39 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.93 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  41.44 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  41.82 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.34 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  41.3 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.53 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  39.42 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  36.46 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.33 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  43.69 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.22 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.92 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  29.46 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.94 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  38.33 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  44.76 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.13 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.84 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.38 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  40.22 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.82 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.43 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  46.39 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  35.42 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0349  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.49 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.89 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.67 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.47 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  29.93 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.05 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  45.92 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  44.21 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  35.88 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
201 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
354 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  35.58 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  40 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.06 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.21 
 
 
503 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 
219 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  41 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.71 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.97 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.8 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
209 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
634 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.57 
 
 
205 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>