More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4215 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  100 
 
 
208 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  92.2 
 
 
208 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  62.12 
 
 
205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  61.31 
 
 
206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  59.02 
 
 
229 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  57.07 
 
 
208 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
208 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.62 
 
 
212 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  37.26 
 
 
215 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  35.98 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  33.15 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  37.13 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  42.99 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  31.31 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.24 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  31.55 
 
 
2975 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32 
 
 
259 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.9 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  40 
 
 
474 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.24 
 
 
269 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
275 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.89 
 
 
287 aa  58.9  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
269 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
258 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
257 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.05 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  29.79 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  37.59 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  31.68 
 
 
4212 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  31.68 
 
 
5778 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  31.68 
 
 
5993 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  31.68 
 
 
5915 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  31.68 
 
 
5822 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  32.7 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  37 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.15 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4887  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  30.71 
 
 
194 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0640  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.91 
 
 
432 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00257211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
270 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
270 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  37.8 
 
 
241 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
270 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.85 
 
 
457 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  33.59 
 
 
266 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.08 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  35.71 
 
 
270 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  33.59 
 
 
266 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 
337 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  31.58 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  33.66 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.47 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
270 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  27.16 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.88 
 
 
268 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  39.56 
 
 
502 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  38.46 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003861  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.48 
 
 
418 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 
155 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  39.6 
 
 
422 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.500309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>