More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2820 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  100 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  31.7 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0316  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.25 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.09 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0349  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36.15 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.3 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.67 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.85 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.07 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.86 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.81 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  36.19 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.84 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  40.86 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  40.86 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.35 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.26 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.33 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.66 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  34.11 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.29 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  33.56 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.11 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.4 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  33.9 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.69 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.9 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.16 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.59 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.18 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  34.67 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.4 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.97 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  33.56 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.19 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.3 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  32.88 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  39.62 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.58 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.57 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.29 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  36.17 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.34 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.67 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.39 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  37.11 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>