More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2798 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2798  methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  72.32 
 
 
273 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  36.48 
 
 
266 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0349  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.9 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.61 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.71 
 
 
217 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36.75 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3036  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.84 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133888  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28 
 
 
210 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5064  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  42 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.152165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
457 aa  62  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4465  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4097  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0403  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.25 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306332  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  30.99 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4578  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.22 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30493  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.48 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0349  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  34 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
215 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.91 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  31.5 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.58 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.78 
 
 
220 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.11 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  27.69 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0356  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
252 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  29.58 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  28.98 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.43 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34 
 
 
199 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.16 
 
 
207 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.12 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
189 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.06 
 
 
229 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
349 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  24.8 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.43 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.43 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.31 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  26.8 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  29.29 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.94 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.58 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.43 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.3 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
319 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  30.94 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.69 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.78 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.25 
 
 
155 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  32.08 
 
 
221 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
196 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  26.8 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 
233 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.75 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  29.23 
 
 
325 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  42 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.21 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.43 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  24.64 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>