More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0720 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  72.69 
 
 
221 aa  308  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
265 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.44 
 
 
225 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  35.32 
 
 
246 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  40.72 
 
 
299 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
273 aa  98.6  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  38.51 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  38.79 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
248 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.61 
 
 
503 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.95 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  37.76 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  35.43 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.71 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.01 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  37.08 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  36.36 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  35.96 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  36.36 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  36.36 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  36.36 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  36.36 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  35.96 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.46 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
457 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
283 aa  62.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
293 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
305 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.83 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.29 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.01 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.15 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  31.25 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
362 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.15 
 
 
265 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  39.81 
 
 
276 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  34.04 
 
 
285 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.54 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.4 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.78 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
429 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  30.1 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
279 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>