More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0026 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  65.59 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  49.38 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  45.06 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1133  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.28 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  40.96 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  39.16 
 
 		 216 aa  92  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 213 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 225 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  41.1 
 
 		 194 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  49.48 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.75 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  42.86 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.76 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.78 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  47.19 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.38 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  36.27 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  33.05 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.83 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.88 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.61 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.21 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  39.64 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.06 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.63 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.77 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.92 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2043  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.13 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  39.13 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.39 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.75 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.04 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.34 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.9 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  35 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  38.37 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.61 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.93 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>