More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1394 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  99.19 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1581  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
232 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000326286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  32.94 
 
 
245 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0406  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.678901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1722  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0192579  decreased coverage  0.00000164865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
265 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.73 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.81 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.62 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  40.16 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.45 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  36.04 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  34.87 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.17 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  31.37 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.79 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.46 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  38.62 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  36.11 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  38.46 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.81 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.11 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.06 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.06 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.24 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.42 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.24 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.86 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.58 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.24 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  46.24 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.86 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4089  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.37 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.91 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.86 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.24 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.72 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  34.27 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  39.64 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.92 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  42 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  32.72 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  39.6 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.86 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.97 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  35.97 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  36.04 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.27 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.07 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.01 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.66 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.91 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.72 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>