More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0189 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  83.02 
 
 		 216 aa  362  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  83.02 
 
 		 216 aa  362  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  81.13 
 
 		 216 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  82.9 
 
 		 194 aa  328  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  54.72 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  44.02 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  37.89 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 273 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  37.22 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.7 
 
 		 265 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.98 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.97 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  45.35 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  40.16 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  36.46 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1587  SAM-dependent methyltransferase  29.38 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  44.23 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.44 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.46 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.17 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.96 
 
 		 269 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  25 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.76 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  43.01 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.15 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  37.39 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.85 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.9 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  34.96 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.87 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  42.45 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.75 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.29 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.87 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  30.99 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  37.25 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  42.53 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  40.65 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  35.35 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.32 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>