More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1607 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.36 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  41.9 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  41.9 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  36.56 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  42 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.2 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  35.23 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  34.96 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.04 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.79 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  39.05 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  32.74 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.64 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.91 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  34.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 634 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.84 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  34.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.67 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.13 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  33.73 
 
 		 391 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  33.91 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1677  hypothetical protein  36.26 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00018407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.48 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  25.81 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  28.44 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1480  hypothetical protein  30.23 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.596221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.33 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2496  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  37.25 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.26 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0152496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  30.68 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.67 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.3 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.3 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.55 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.73 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  30.68 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.5 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.25 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4919  methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  37.25 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0634  hypothetical protein  32.98 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00503727  hitchhiker  0.0000898788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  37.78 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.78 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  31.67 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>